1.學習正確的魚類知識，以及深入探索海洋與魚類的奧秘。
2.基於「以海洋漁業為主，但不以海洋漁業為限」的思維，以培育環境生物、漁業技術、漁場生態、海洋環境保護、漁業資源保育與復育、環境生物評估與管理等領域之人材為宗旨。
3.在大學部著重於環境生物與漁業科學之基礎養成專業知識教育、教導漁業資源、海洋生物生產及漁業資源管理等。